消化疾病中心是重庆西区医院重点打造的集临床医疗、科研、教学、防治一体的临床诊疗中心，技术实力处于重庆市先进水平。由著名外科专家梁平教授担任中心主任，汇集陆军军医大学西南医院、新桥医院、大坪医院的普外科、肝胆科、消化科教授组成专家团队。技术能力强、临床经验丰富、患者满意度高。中心紧跟世界医学发展趋势，依据消化系统疾病的特点，围绕外科治疗微创化和内科治疗外科化，为患者提供优势诊疗方案。努力打造全国一流、西部第一的区域专科医疗中心。  

中心设有肝胆外科、普通外科（胃肠外科与甲状腺乳腺外科）、消化内科及内镜介入中心。除常规开展腹部、乳腺、甲状腺疾病诊疗外，能够实现复杂、疑难、危重患者快速多学科联合会诊。特别是在双镜联合治疗消化道肿瘤、消化道出血，以及重症急性胰腺炎的救治方面具有丰富的临床经验。